Det var i august i 2001 at Bush, etter å ha tenkt seg lenge om, og etter å ha konsultert både Gud og sine rådgivere, falt ned på en «mellomløsning» i spørsmålet om forskning på embryonale stamceller. Det var ikke lett for Bush, som jo hadde gått til valg på motstand mot å bruke embryoer til forskning, men som samtidig fikk høre at dette ville bremse forskning som kunne berge mange liv, og også skade USAs legemiddelindustri. Han prøvde derfor å gi litt til begge sider, ved å bestemme at kun forskning på embryonale stamcellelinjer som allerede eksisterte, kunne få støtte.